但很多业内人士认为，加大对医院的财政拨付并不是那么简单的事情，中国社科院财贸所研究员杨志勇表示，“如果政府今年要为公立医院破除‘以药养医’机制买单的话，势必要加大医疗卫生投入。”因为取消药品加成后，财政对试点城市公立医院由此产生的亏损需要加大投入，而这笔投入十分巨大，即使今年按照2011年医疗卫生总投入的增长比例继续增长，也很难满足公立医院的需要。甚至有专家指出，目前财政投入的增幅已达到年均三成，如果想要完全覆盖15%的医药加成，势必会更多，甚至达到60%、70%的增幅，显然难以实现。因此在财政投入难以出现大规模攀升的情况下如何祛除药品加成这一“毒瘤”，或将成为医改第二阶段最重的难题之一。
也有不少专家提出了不同看法，国务院医改专家咨询委员会委员、北大光华管理学院教授刘国恩认为：“如果其他方面不进行配套改革，特别是公立医院从组织、结构、管理、经营和性质方面不改变的话，在中国当前发展阶段，财政、编制、医保等各种传统行政手段还对公立医院进行约束的前提下，简单通过医和药分开来解决旧的计划经济制度下形成的以药养医，基本上是不可能的。
”
中国社科院经济研究所研究员朱恒鹏认为，即使实施了取消药品加成（零差价）并且配套以收支两条线制度，医院及其以上还是会和过去一样卖药；医院、医生的行为不会改变，药品供应商的行为也不会改变。老百姓面对的还是药价虚高、过度用药、药品费用居高不下。
一方面专家与医生们在担忧“医药分离”之后医院如何养的问题，另一方面，药企似乎也对“医药分离”抱有复杂的心态，这不仅能给药企带来新的机遇，当然也会带来新一轮的重新洗牌，并不是每个药企都有实力应对基础药目录的一轮轮招标及市场竞争的洗礼。
专家预计2012年药品市场规模增速、医药行业增速分别为12%、17%左右，环比增幅进一步回落，政策变局与资本主导时代已来临。官方数据显示，在8,500多亿元增量投入的支持下，中国医保覆盖面目前已达95%，基层医疗机构全部实施了基本药物制度，人均卫生费用占消费比重已超11%。另外有统计数据显示，2011年包括县级医院在内的基层医药市场，规模超1,600亿元，整体占比为18.7%。
然而，摆在药企面前的诸多考验也一目了然，新GMP的实施、商业渠道的整合、“两票制”的推行、药品价格的调整、抗生素的分级管理、医院药品结算方式的变化、单病种价格模式的推进、医保管理机构的日趋主动、国家推行的基本药物制度将进一步向基层延伸、基药目录也将在年内调整扩充等问题，都成为药企迈入“黄金十年”路上的必经试炼，同时也将对2012年及以后的医药行业产生着深远影响，而药企业将在2012年更加切实地感受到政策对市场的驱动力。
根据此前预测，2010－2014年总值2,090亿美元的专利药将到期。显而易见，原研药的企业黄金时代正在远逝，“专利悬崖”让跨国药企头疼。同时，众多外企反映，新药审批难度增加，使得企业无法通过引进新的原研药补充既有的业绩下滑。某药企管理人员表示，“目前申报新药基本批不下来，因此有的企业干脆不再愿意投资了。国内企业也有专注于原研的，但目前政策导向显然不支持原创，而是把企业挤向低层次竞争。”药品审评资源的紧张已严重影响到企业的经营。
“新药进不来，老药又要降价被迫离开市场，外资企业面临的市场独占期正逐步缩短。”中国外商投资企业协会药品研制和开发行业委员会（RDPAC）媒介总监左玉增表示。因此，辉瑞、葛兰素史克、山德士等正瞄准新医改实施带来的市场扩容，加快推出品牌仿制药，并加大基层市场投入。另外，也有不少跨国医药巨头选择与国内药企合作，降低生产、销售成本，共同争夺三四线用药市场。
www.liushuye.com不过，某企业高管坦言，“其实在中国，专利药的专利保护到期这样的状况对我们的影响很小，在战略部署上并不需要做很大变动。毫不夸张地说，很多时候专利药一上市，仿制药就已经出现了。原研药与仿制药之间的竞争从一开始就存在，甚至仿制药上市的时间比原研药还要早。其实影响我们战略部署的往往是政策。”
但是，大型外资药企大刀阔斧地集中奔赴仿制药市场及基层市场却给国内的中小药企带来了致命的危机。国内中小型药企因为资金、规模、研发能力等软硬件的限制，更多关注的是仿制药及基层市场，而众多有实力企业的进入，无疑会让中小企业进行一次残酷的洗牌。
“我们其实已经发现跨国药企在中国市场动作越来越频繁。目前，三甲医院使用的药品近五成为外资品牌。现在，国外药企又在向三四线城市以及社区医院渗透，这对中国传统医药工业的冲击很大，也让国内药企颇为忧心。”某国内药企高管坦言。
